NGS DreamPrep™

Solution robotique entièrement automatisée pour la préparation de bibliothèques NGS

NGS DreamPrep est une solution entièrement optimisée pour la préparation automatisée de bibliothèques NGS et de CQ. Elle minimise les interventions manuelles, ce qui permet de gagner du temps et de fournir des bibliothèques cohérentes et prêtes au séquençage, pour un large éventail d’applications de recherche.

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Tab 01 / Solution complète
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NGS DreamPrep combine la station d’automatisation Fluent®, le lecteur de plaques Infinite® F Nano+ et les kits de préparation de bibliothèques Genomics de Tecan afin de générer des bibliothèques prêtes pour le séquençage avec une vitesse et une précision sans précédent. Cette approche révolutionnaire propose une préparation, une quantification, une normalisation et une mise en commun des bibliothèques NGS dans un seul flux de travail automatisé.

La méthode innovante de quantification de bibliothèques NuQuant® de Tecan utilise le lecteur intégré Infinite pour automatiser entièrement CQ sans perte d’échantillons en moins de six minutes, rendant inutile le recours à un CQ lent et coûteux par PCR quantitative ou par électrophorèse capillaire.

Chaque station NGS DreamPrep est fournie avec des exemples de méthodes* pour les kits de réactifs Genomics de Tecan, y compris la technologie AnyDeplete™ pour la réduction du nombre de transcriptions de lectures non souhaitées des données de séquençage.

NGS DreamPrep

 

Points forts du système

  • Bibliothèques de séquençage de l’ADN, normalisées et prêtes pour le séquençage en moins de 4 heures
  • Bibliothèques de séquençage de l’ARNm, quantifiées et prêtes pour le séquençage en 9 heures au lieu de 14 heures
  • CQ intégré complet de bibliothèques en moins de 6 minutes sans perte d’échantillons
  • Flux de travail en complément uniquement pour le séquençage de l’ADN, plus intervention minimale pour le séquençage de l’ARN
  • Point de contact unique pour l’automatisation, les réactifs, les consommables, le support pour l’application, etc.
  • Interface utilisateur intuitive sur écran tactile adaptable selon vos besoins

* Les exemples de méthodes n’ont pas été validés. Veuillez faire une copie de cette méthode afin de l’adapter pour prendre en charge et valider votre flux de travail en fonction de l’utilisation prévue et des protocoles de laboratoire souhaités. Tecan décline toute responsabilité quant à la performance des exemples de méthodes.




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Tab 02 / Automatisation
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Les avancées technologiques rapides ont fait du séquençage nouvelle génération (NGS) une option fiable et simple pour les dosages génomiques, mais la préparation des bibliothèques demeure un défi pour les applications de haut débit. La vitesse, l’exactitude et la précision qui caractérisent Fluent en font une plateforme parfaitement adaptée pour la préparation de bibliothèques NGS, réduisant la variabilité des processus et assurant une plus grande reproductibilité entre opérateurs et sur la durée.

Les trois bras du système, indépendants et dédiés à une tâche, opèrent en parallèle pour assurer un traitement rapide et efficace. L’interface sur écran tactile intégrée guide les utilisateurs dans leurs tâches quotidiennes et est très facile à personnaliser pour répondre aux besoins de votre laboratoire et de vos flux de travail, vous assurant un fonctionnement simple. Et avec les fonctions intégrées de gestion des utilisateurs et d’approbation des méthodes, vous avez la garantie de protocoles sécurisés et de performances optimales.

Thermocyclage sur le plateau pour des cycles autonomes plus longs

Lecteur de plaques intégré pour les CQ sans perte d’échantillons

Séparation magnétique pour les nettoyages de billes

La fonction d’approbation des méthodes assure la conformité avec les SOP et les protocoles validés

Interface intuitive sur écran tactile

Traitement en parallèle avec trois bras dédiés à une tâche pour maximiser le débit




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Tab 03 / Détection
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Quantification sensible et rapide

Le lecteur multimode Infinite F Nano+ rassemble des modes de lecture d’absorbance et de fluorescence haute sensibilité dans un seul instrument compact.

Il associe la haute sensibilité des dosages avec détection par fluorescence et la vitesse que fournit la lecture de formats de plaques jusqu’à 384 puits.

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La quantification de bibliothèques NGS est une étape cruciale pour la réussite d’un cycle de séquençage. Déterminer avec exactitude le nombre de molécules séquençables prend toute son importance pour les nouveaux séquenceurs haute capacité tels que le NovaSeq.

NuQuant est une nouvelle méthode de quantification de bibliothèques qui mesure avec précision la concentration molaire de ces dernières, sans qu’il faille procéder à une analyse séparée de la taille des fragments. Cette méthode exclusive utilise un marqueur fluorescent qui est incorporé dans les molécules durant la préparation de la bibliothèque. NuQuant ne dépend pas de la taille de la bibliothèque, la molarité de cette dernière peut donc être mesurée directement avec des spectrofluorimètres tels que Infinite F Nano+.

CQ intégré des bibliothèques en moins de 6 minutes – la quantification des bibliothèques à l’aide de NuQuant sur le lecteur de plaques élimine la nécessité d’étapes manuelles de PCR quantitative ou d’électrophorèse capillaire supplémentaires pour quantifier les bibliothèques, ce qui se traduit par une économie de temps, de ressources et de matériel précieux de bibliothèque.

NGS Dreamprep - Fluent

Après une purification finale des bibliothèques d’ADN dans une plaque à 96 puits avec Fluent, la fluorescence des bibliothèques et des standards est mesurée sur le lecteur de plaques Infinite. La molarité déterminée pour chaque bibliothèque peut ensuite être utilisée pour une mise en commun équilibrée et un séquençage ultérieur sur des instruments Illumina.




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Tab 04 / Réactifs
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NGS DreamPrep est une solution complète conçue et optimisée pour la préparation et la quantification entièrement automatisées de bibliothèques d’ADN. Elle associe les kits de préparation de bibliothèques Celero DNA-Seq et Universal Plus mRNA-Seq avec une station d’automatisation Fluent et un lecteur de plaques intégré Infinite®, permettant aux utilisateurs de transformer jusqu’à 96 échantillons d’ADN dans des bibliothèques aisément normalisées.

Celero DNA-Seq

Le kit de préparation de bibliothèques de séquençage de l’ADN Celero PCR Workflow avec fragmentation enzymatique est un simple flux de travail a dans un tube unique, en complément uniquement, avec juste une étape de purification de billes post-amplification. Les bibliothèques d’ADN Celero peuvent être préparées, quantifiées, normalisées et mises en commun en moins de quatre heures sur la station d’automatisation Fluent, contre sept heures pour la préparation de bibliothèques et la quantification qPCR avec d’autres kits. Principaux points forts de ce kit de préparation de bibliothèques de séquençage de l’ADN :

  • Large plage dynamique d’entrées de 10 ng à 500 ng
  • Flux de travail en trois étapes, en complément uniquement
  • Fragmentation enzymatique efficace
  • Technologie DimerFree éliminant les variateurs d’intensité des adaptateurs
  • Méthode de quantification des bibliothèques NuQuant intégrée sans supplément de coût pour une quantification exacte des concentrations des bibliothèques (en nM)

NGS Dreamprep - Celero Workflow

Le kit de préparation de bibliothèques Celero offre un simple flux de travail, en complément uniquement, pour générer des bibliothèques quantifiées prêtes pour le séquençage.

Universal Plus mRNA-Seq

Le kit de préparation de bibliothèques Universal Plus mRNA-Seq est caractérisé par un flux de travail de bout en bout efficace avec un large éventail d’entrées pour l’analyse des transcriptions de codage. Les bibliothèques Universal Plus mRNA peuvent être préparées, quantifiées, normalisées et mises en commun en moins de neuf heures sur la station d’automatisation Fluent, contre plus de quatorze heures pour la préparation de bibliothèques et la quantification qPCR manuelles ou automatisées avec d’autres kits. Caractéristiques principales de ce kit de préparation de bibliothèques de séquençage ARNm :

  • Large plage dynamique d’entrées de 10 ng à 1 µg
  • Technologie DimerFree éliminant les variateurs d’intensité des adaptateurs
  • Méthode de quantification des bibliothèques NuQuant intégrée sans supplément de coût pour une quantification exacte des concentrations des bibliothèques (en nM)
  • Technologie AnyDeplete intégrée qui permet d’éliminer les transcriptions non souhaitées après la préparation de bibliothèques afin de maximiser les lectures de séquençage informatives

NGS Dreamprep - Steps Workflow

Le kit Universal Plus mRNA-Seq offre un flux de travail simplifié pour la génération de bibliothèques quantifiées prêtes pour le séquençage. Le flux de travail peut inclure une étape de réduction du nombre de transcriptions adaptable.




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Tab 05 / Docu-mentation
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Brochures

NGS DreamPrep est une solution autonome complète qui combine la station d’automatisation Fluent®, le lecteur de plaques Infinite® F Nano+ et les kits innovants de préparation de bibliothèques Genomics de Tecan pour créer des bibliothèques prêtes pour le séquençage avec une intervention manuelle minimale.

Notes d’application

Le kit de séquençage de l’ADN Celero PCR Workflow avec fragmentation enzymatique offre un flux de travail simple, en complément uniquement, pour générer des bibliothèques quantifiées prêtes pour le séquençage.

Le kit de préparation de bibliothèques Universal Plus mRNA-Seq avec NuQuant offre un flux de travail simplifié pour la génération de bibliothèques quantifiées prêtes pour le séquençage.

NuQuant® est une nouvelle méthode de quantification de bibliothèques qui mesure avec précision la concentration molaire de ces dernières, sans qu’il faille procéder à une analyse séparée de la taille des fragments.

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